为防止交叉感染及积灰，吊顶、墙面、地面的装饰用材要求耐磨，不起尘、易清洗、耐腐蚀。在洁净厂房内要求踢脚与地面交界处必须为圆角，为避免意外事故发生，要求阳角也做成圆角（但门洞上口这些地方可例外），墙上做防撞板。外露的木质和石膏材料易吸湿变形、开裂、积灰、长菌、贮菌，所以要求在洁净厂房内不得使用这些材料。为防止空气途径的污染，进入洁净厂房的门需设置吊挂式自动推拉门，以减少外界气流干扰，避免地面出现凹槽积污。洁净厂房门的自动延时关闭装置安装、工作正常。洁净厂房是以空气净化为手段，具有一定正压（或负压），要求气密性良好，所以洁净厂房内所有拼缝必须平整严密。为了避免突出与不平而积尘，墙面上的插销、药品柜、吊顶上的灯具等均应暗装，在不同材料的接缝处要求密封。

洁净厂房对净化空调系统的要求较为特殊和严格，禁止在洁净厂房内使用普通的风机盘管机组或空调器，避免发霉和滋生细菌，强调整个洁净厂房内的湿度控制。新风量按规定确定，并取其最大值。洁净厂房空调管路应短、直、顺，尽量减少管件，采用气流性能良好、涡流区小的管件和静压箱，管路系统不应使用软管。Ⅰ～Ⅲ级洁净厂房内集中布置于实验台上方的送风口，应使包括实验台的一定区域处于洁净气流形成的主流区内。所有洁净厂房，应采用双侧下部回风，不应采用四角或四侧回风。采用室内回风，不设余压阀向走廊回风，本室回风通过本室回风管循环解决。软接头材料应为双层，对防止其表面长霉有一定作用。回风口中设置碳纤维过滤层，以吸收室内回风中的异味，回风口的百叶片应选用竖向可调叶片，以减少横向叶片上的积尘，如采用对开多叶联动叶片，不仅可保持定风向，还可起到平衡各回风口的风量作用。与循环空气接触的金属件外表必须有保护层，避免洁净厂房内所使用的药品、消毒剂等使金属表面腐蚀。

洁净厂房内的给水需要冷热水兼有，供水要不间断，水量和水压要保证，并且水质要可靠。对水质标准要求较高的洁净厂房，其刷手用水除符合饮用水标准外，还宜安装除菌过滤器及紫外线等水质消毒灭菌器。给水管道不能直接连接到任何可能引起污染的卫生器具及设备上，除非在这种连接系统中，留有空气隔断装置或设有行之有效的预防回流装置。洁净厂房内不应设置地漏，地漏应设置在刷手间及卫生器具旁且必须加密封盖。检测实验过程中污物量较大，为了防止排水管道堵塞，适当加大洁净厂房排水管道口径，可减少日常的维修量。

由于工程施工往往出现空调净化系统的施工与围护结构的施工不是一个单位承担的情况，给工程质量造成隐患，特别强调洁净厂房的施工必须以空调净化为核心，统一指挥施工。为保证质量，在洁净部（室）所在的建筑物验收之后，还应对其单独验收。不论施工方有无完整的调试报告，都不能代替综合性能全面评定。由于洁净厂房是多功能的综合整体，空气洁净度或细菌浓度单项指标不能反映洁净厂房可以投入使用的整体性能；又由于竣工验收主要考查施工质量，综合性能全面评定主要考查设计质量，因此不能互相代替，并且只有竣工验收之后才可进行全面评定。

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